上海合作組織是在“上海五國(guó)”元首會(huì)晤機(jī)制的基礎(chǔ)上成立的。
2001年6月14日，“上海五國(guó)” 元首在上海舉行第六次會(huì)晤，烏茲別克斯坦以完全平等成員的身份加入“上海五國(guó)”。15日，6國(guó)元首舉行首次會(huì)晤，并簽署了《上海合作組織成立宣言》，宣告上海合作組織正式成立。
2002年6月7日，上海合作組織成員國(guó)元首在圣彼得堡舉行第二次會(huì)晤，簽署《上海合作組織憲章》。憲章對(duì)上海合作組織宗旨、組織結(jié)構(gòu)、運(yùn)作形式、合作方向及對(duì)外交往等原則作了明確闡述，標(biāo)志著該組織從國(guó)際法意義上得以真正建立。
2003年5月29日，上海合作組織成員國(guó)元首第三次會(huì)晤在莫斯科舉行，討論了在新形勢(shì)下如何抓住機(jī)遇、應(yīng)對(duì)挑戰(zhàn)、加強(qiáng)協(xié)調(diào)、擴(kuò)大合作、促進(jìn)地區(qū)和平與發(fā)展等重大問(wèn)題，并達(dá)成廣泛共識(shí)，簽署了《上海合作組織成員國(guó)元首宣言》。時(shí)任中國(guó)駐俄羅斯大使張德廣被任命為該組織秘書(shū)長(zhǎng)。
2004年6月17日，上海合作組織成員國(guó)元首第四次會(huì)晤在烏茲別克斯坦首都塔什干舉行。塔什干峰會(huì)標(biāo)志著成立3年的上海合作組織正式結(jié)束初創(chuàng)階段，進(jìn)入了全面發(fā)展的新時(shí)期。在這次峰會(huì)上，蒙古國(guó)被吸收為上海合作組織觀察員。
2005年7月5日，上海合作組織成員國(guó)元首第五次會(huì)晤在哈薩克斯坦首都阿斯塔納舉行。6國(guó)元首簽署了《上海合作組織成員國(guó)元首宣言》等重要文件，并決定給予巴基斯坦、伊朗、印度觀察員地位。
2006年6月15日 上海合作組織成員國(guó)元首理事會(huì)第六次會(huì)議在上海舉行。六國(guó)元首簽署了《上海合作組織五周年宣言》，發(fā)表了《上海合作組織成員國(guó)元首理事會(huì)第六次會(huì)議聯(lián)合公報(bào) 》。
